Protein–RNA interactions for Protein: P35918

Kdr, Vascular endothelial growth factor receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdrP35918 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KdrP35918 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KdrP35918 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KdrP35918 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KdrP35918 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KdrP35918 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KdrP35918 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KdrP35918 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KdrP35918 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KdrP35918 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KdrP35918 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KdrP35918 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KdrP35918 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KdrP35918 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KdrP35918 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KdrP35918 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KdrP35918 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
KdrP35918 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KdrP35918 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KdrP35918 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KdrP35918 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KdrP35918 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KdrP35918 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KdrP35918 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KdrP35918 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
KdrP35918 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KdrP35918 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KdrP35918 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KdrP35918 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KdrP35918 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KdrP35918 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KdrP35918 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KdrP35918 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
KdrP35918 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KdrP35918 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KdrP35918 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KdrP35918 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KdrP35918 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KdrP35918 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
KdrP35918 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KdrP35918 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KdrP35918 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KdrP35918 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KdrP35918 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KdrP35918 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KdrP35918 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KdrP35918 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KdrP35918 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KdrP35918 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KdrP35918 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
KdrP35918 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KdrP35918 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KdrP35918 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KdrP35918 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KdrP35918 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KdrP35918 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
KdrP35918 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KdrP35918 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
KdrP35918 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KdrP35918 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KdrP35918 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KdrP35918 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
KdrP35918 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
KdrP35918 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
KdrP35918 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
KdrP35918 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
KdrP35918 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
KdrP35918 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
KdrP35918 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
KdrP35918 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
KdrP35918 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
KdrP35918 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
KdrP35918 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
KdrP35918 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
KdrP35918 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
KdrP35918 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
KdrP35918 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
KdrP35918 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
KdrP35918 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
KdrP35918 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
KdrP35918 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
KdrP35918 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
KdrP35918 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
KdrP35918 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
KdrP35918 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KdrP35918 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KdrP35918 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KdrP35918 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
KdrP35918 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KdrP35918 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
KdrP35918 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
KdrP35918 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC31.82■■■□□ 2.69
KdrP35918 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
KdrP35918 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.69
KdrP35918 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
KdrP35918 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
KdrP35918 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
KdrP35918 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
KdrP35918 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
KdrP35918 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms