Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT2P35908 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KRT2P35908 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRT2P35908 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRT2P35908 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT2P35908 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT2P35908 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT2P35908 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT2P35908 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT2P35908 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT2P35908 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT2P35908 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT2P35908 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT2P35908 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT2P35908 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT2P35908 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT2P35908 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT2P35908 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT2P35908 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT2P35908 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT2P35908 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT2P35908 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT2P35908 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KRT2P35908 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KRT2P35908 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT2P35908 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT2P35908 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT2P35908 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT2P35908 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT2P35908 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT2P35908 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT2P35908 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT2P35908 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT2P35908 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT2P35908 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT2P35908 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT2P35908 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT2P35908 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT2P35908 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT2P35908 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT2P35908 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT2P35908 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT2P35908 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT2P35908 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT2P35908 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT2P35908 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT2P35908 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT2P35908 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT2P35908 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT2P35908 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
KRT2P35908 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT2P35908 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT2P35908 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT2P35908 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT2P35908 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT2P35908 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT2P35908 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT2P35908 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT2P35908 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT2P35908 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT2P35908 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT2P35908 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT2P35908 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT2P35908 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT2P35908 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT2P35908 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT2P35908 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT2P35908 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT2P35908 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT2P35908 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT2P35908 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT2P35908 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT2P35908 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT2P35908 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT2P35908 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT2P35908 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT2P35908 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT2P35908 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT2P35908 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT2P35908 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT2P35908 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT2P35908 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT2P35908 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT2P35908 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT2P35908 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT2P35908 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT2P35908 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT2P35908 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT2P35908 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT2P35908 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT2P35908 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT2P35908 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT2P35908 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT2P35908 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT2P35908 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT2P35908 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KRT2P35908 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT2P35908 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT2P35908 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT2P35908 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms