Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
PtprkP35822 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PtprkP35822 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PtprkP35822 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
PtprkP35822 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
PtprkP35822 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
PtprkP35822 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
PtprkP35822 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PtprkP35822 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
PtprkP35822 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PtprkP35822 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PtprkP35822 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PtprkP35822 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PtprkP35822 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PtprkP35822 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PtprkP35822 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PtprkP35822 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PtprkP35822 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PtprkP35822 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
PtprkP35822 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PtprkP35822 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PtprkP35822 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PtprkP35822 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PtprkP35822 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PtprkP35822 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PtprkP35822 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PtprkP35822 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PtprkP35822 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PtprkP35822 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PtprkP35822 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PtprkP35822 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PtprkP35822 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
PtprkP35822 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PtprkP35822 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PtprkP35822 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PtprkP35822 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PtprkP35822 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PtprkP35822 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PtprkP35822 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PtprkP35822 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PtprkP35822 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PtprkP35822 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PtprkP35822 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PtprkP35822 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PtprkP35822 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PtprkP35822 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PtprkP35822 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PtprkP35822 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PtprkP35822 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PtprkP35822 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PtprkP35822 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PtprkP35822 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PtprkP35822 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PtprkP35822 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PtprkP35822 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PtprkP35822 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PtprkP35822 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PtprkP35822 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PtprkP35822 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PtprkP35822 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PtprkP35822 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PtprkP35822 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PtprkP35822 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PtprkP35822 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
PtprkP35822 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
PtprkP35822 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PtprkP35822 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PtprkP35822 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PtprkP35822 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
PtprkP35822 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PtprkP35822 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.62
PtprkP35822 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PtprkP35822 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PtprkP35822 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PtprkP35822 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PtprkP35822 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PtprkP35822 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PtprkP35822 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
PtprkP35822 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PtprkP35822 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PtprkP35822 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PtprkP35822 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PtprkP35822 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PtprkP35822 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PtprkP35822 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
PtprkP35822 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PtprkP35822 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PtprkP35822 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PtprkP35822 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PtprkP35822 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PtprkP35822 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PtprkP35822 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PtprkP35822 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PtprkP35822 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
PtprkP35822 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
PtprkP35822 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PtprkP35822 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PtprkP35822 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PtprkP35822 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PtprkP35822 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms