Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOX5P35711 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOX5P35711 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOX5P35711 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOX5P35711 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOX5P35711 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SOX5P35711 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOX5P35711 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SOX5P35711 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SOX5P35711 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOX5P35711 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOX5P35711 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOX5P35711 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOX5P35711 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOX5P35711 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOX5P35711 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOX5P35711 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOX5P35711 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOX5P35711 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOX5P35711 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOX5P35711 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOX5P35711 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOX5P35711 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOX5P35711 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOX5P35711 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOX5P35711 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOX5P35711 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOX5P35711 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SOX5P35711 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOX5P35711 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOX5P35711 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOX5P35711 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOX5P35711 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOX5P35711 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOX5P35711 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOX5P35711 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOX5P35711 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOX5P35711 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOX5P35711 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOX5P35711 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOX5P35711 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOX5P35711 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOX5P35711 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOX5P35711 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOX5P35711 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOX5P35711 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOX5P35711 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOX5P35711 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOX5P35711 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOX5P35711 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOX5P35711 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOX5P35711 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOX5P35711 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOX5P35711 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOX5P35711 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SOX5P35711 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOX5P35711 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOX5P35711 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOX5P35711 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOX5P35711 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOX5P35711 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX5P35711 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX5P35711 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX5P35711 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX5P35711 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX5P35711 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX5P35711 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX5P35711 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX5P35711 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX5P35711 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX5P35711 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX5P35711 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX5P35711 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX5P35711 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX5P35711 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX5P35711 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX5P35711 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX5P35711 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOX5P35711 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOX5P35711 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOX5P35711 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOX5P35711 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SOX5P35711 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOX5P35711 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOX5P35711 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOX5P35711 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOX5P35711 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SOX5P35711 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SOX5P35711 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SOX5P35711 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SOX5P35711 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SOX5P35711 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOX5P35711 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOX5P35711 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SOX5P35711 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOX5P35711 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOX5P35711 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX5P35711 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX5P35711 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX5P35711 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms