Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT9P35527 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT9P35527 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT9P35527 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT9P35527 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT9P35527 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT9P35527 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT9P35527 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT9P35527 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT9P35527 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT9P35527 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT9P35527 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT9P35527 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT9P35527 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT9P35527 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT9P35527 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT9P35527 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT9P35527 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT9P35527 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT9P35527 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT9P35527 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT9P35527 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT9P35527 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT9P35527 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT9P35527 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT9P35527 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT9P35527 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT9P35527 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT9P35527 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT9P35527 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT9P35527 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT9P35527 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT9P35527 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT9P35527 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT9P35527 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT9P35527 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT9P35527 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT9P35527 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT9P35527 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT9P35527 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT9P35527 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT9P35527 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT9P35527 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT9P35527 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT9P35527 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT9P35527 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT9P35527 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT9P35527 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT9P35527 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT9P35527 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT9P35527 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT9P35527 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT9P35527 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT9P35527 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT9P35527 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT9P35527 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT9P35527 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT9P35527 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT9P35527 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT9P35527 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT9P35527 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT9P35527 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT9P35527 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT9P35527 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT9P35527 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT9P35527 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT9P35527 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT9P35527 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT9P35527 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT9P35527 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT9P35527 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT9P35527 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT9P35527 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT9P35527 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT9P35527 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT9P35527 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT9P35527 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT9P35527 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT9P35527 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT9P35527 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT9P35527 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT9P35527 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT9P35527 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT9P35527 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT9P35527 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT9P35527 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT9P35527 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT9P35527 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT9P35527 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT9P35527 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT9P35527 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT9P35527 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT9P35527 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT9P35527 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT9P35527 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT9P35527 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT9P35527 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT9P35527 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT9P35527 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT9P35527 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms