Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MCM5P33992 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MCM5P33992 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MCM5P33992 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MCM5P33992 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MCM5P33992 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MCM5P33992 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MCM5P33992 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MCM5P33992 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MCM5P33992 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MCM5P33992 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MCM5P33992 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MCM5P33992 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MCM5P33992 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MCM5P33992 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MCM5P33992 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MCM5P33992 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MCM5P33992 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MCM5P33992 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MCM5P33992 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MCM5P33992 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MCM5P33992 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MCM5P33992 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MCM5P33992 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MCM5P33992 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MCM5P33992 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MCM5P33992 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
MCM5P33992 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MCM5P33992 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
MCM5P33992 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
MCM5P33992 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
MCM5P33992 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MCM5P33992 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MCM5P33992 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MCM5P33992 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MCM5P33992 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MCM5P33992 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MCM5P33992 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MCM5P33992 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MCM5P33992 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MCM5P33992 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MCM5P33992 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MCM5P33992 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MCM5P33992 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MCM5P33992 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MCM5P33992 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MCM5P33992 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MCM5P33992 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MCM5P33992 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MCM5P33992 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MCM5P33992 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MCM5P33992 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MCM5P33992 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
MCM5P33992 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MCM5P33992 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MCM5P33992 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MCM5P33992 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MCM5P33992 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MCM5P33992 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MCM5P33992 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MCM5P33992 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MCM5P33992 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
MCM5P33992 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
MCM5P33992 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MCM5P33992 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MCM5P33992 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MCM5P33992 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MCM5P33992 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MCM5P33992 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MCM5P33992 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MCM5P33992 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MCM5P33992 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MCM5P33992 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MCM5P33992 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MCM5P33992 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MCM5P33992 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MCM5P33992 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
MCM5P33992 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCM5P33992 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MCM5P33992 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MCM5P33992 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MCM5P33992 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MCM5P33992 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MCM5P33992 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MCM5P33992 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
MCM5P33992 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MCM5P33992 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MCM5P33992 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MCM5P33992 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
MCM5P33992 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MCM5P33992 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MCM5P33992 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MCM5P33992 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MCM5P33992 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MCM5P33992 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MCM5P33992 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MCM5P33992 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MCM5P33992 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MCM5P33992 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MCM5P33992 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms