Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCD1P33897 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCD1P33897 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCD1P33897 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCD1P33897 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCD1P33897 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCD1P33897 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCD1P33897 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCD1P33897 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCD1P33897 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCD1P33897 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCD1P33897 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCD1P33897 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCD1P33897 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCD1P33897 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCD1P33897 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCD1P33897 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCD1P33897 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCD1P33897 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCD1P33897 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCD1P33897 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCD1P33897 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCD1P33897 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCD1P33897 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCD1P33897 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCD1P33897 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCD1P33897 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCD1P33897 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCD1P33897 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCD1P33897 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCD1P33897 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCD1P33897 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCD1P33897 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCD1P33897 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCD1P33897 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCD1P33897 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCD1P33897 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCD1P33897 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCD1P33897 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCD1P33897 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCD1P33897 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCD1P33897 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCD1P33897 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCD1P33897 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCD1P33897 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCD1P33897 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCD1P33897 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ABCD1P33897 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms