Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH5P33151 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH5P33151 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH5P33151 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH5P33151 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDH5P33151 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDH5P33151 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDH5P33151 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDH5P33151 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDH5P33151 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH5P33151 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH5P33151 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH5P33151 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH5P33151 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH5P33151 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH5P33151 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH5P33151 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH5P33151 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH5P33151 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH5P33151 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH5P33151 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH5P33151 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH5P33151 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH5P33151 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH5P33151 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH5P33151 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH5P33151 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH5P33151 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH5P33151 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH5P33151 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH5P33151 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH5P33151 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH5P33151 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH5P33151 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH5P33151 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CDH5P33151 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH5P33151 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH5P33151 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH5P33151 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH5P33151 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH5P33151 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH5P33151 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH5P33151 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH5P33151 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDH5P33151 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDH5P33151 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDH5P33151 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDH5P33151 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CDH5P33151 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH5P33151 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH5P33151 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH5P33151 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH5P33151 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH5P33151 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH5P33151 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH5P33151 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH5P33151 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDH5P33151 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDH5P33151 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDH5P33151 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDH5P33151 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDH5P33151 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDH5P33151 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDH5P33151 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH5P33151 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH5P33151 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH5P33151 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH5P33151 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH5P33151 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH5P33151 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDH5P33151 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDH5P33151 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDH5P33151 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDH5P33151 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDH5P33151 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDH5P33151 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDH5P33151 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDH5P33151 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDH5P33151 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDH5P33151 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDH5P33151 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDH5P33151 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDH5P33151 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDH5P33151 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDH5P33151 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDH5P33151 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDH5P33151 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH5P33151 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH5P33151 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH5P33151 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH5P33151 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH5P33151 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH5P33151 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH5P33151 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH5P33151 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH5P33151 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDH5P33151 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CDH5P33151 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDH5P33151 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDH5P33151 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms