Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP2P32456 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP2P32456 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP2P32456 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP2P32456 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GBP2P32456 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GBP2P32456 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GBP2P32456 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GBP2P32456 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GBP2P32456 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GBP2P32456 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GBP2P32456 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GBP2P32456 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GBP2P32456 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GBP2P32456 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GBP2P32456 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GBP2P32456 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GBP2P32456 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GBP2P32456 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBP2P32456 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBP2P32456 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBP2P32456 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GBP2P32456 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GBP2P32456 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GBP2P32456 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GBP2P32456 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP2P32456 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP2P32456 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP2P32456 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP2P32456 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP2P32456 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP2P32456 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GBP2P32456 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GBP2P32456 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GBP2P32456 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GBP2P32456 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GBP2P32456 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GBP2P32456 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GBP2P32456 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GBP2P32456 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GBP2P32456 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GBP2P32456 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GBP2P32456 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GBP2P32456 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GBP2P32456 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GBP2P32456 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GBP2P32456 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GBP2P32456 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GBP2P32456 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GBP2P32456 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GBP2P32456 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GBP2P32456 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GBP2P32456 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GBP2P32456 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GBP2P32456 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GBP2P32456 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GBP2P32456 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GBP2P32456 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GBP2P32456 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GBP2P32456 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GBP2P32456 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GBP2P32456 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GBP2P32456 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GBP2P32456 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GBP2P32456 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GBP2P32456 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP2P32456 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP2P32456 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP2P32456 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP2P32456 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP2P32456 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GBP2P32456 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GBP2P32456 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GBP2P32456 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GBP2P32456 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GBP2P32456 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GBP2P32456 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GBP2P32456 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GBP2P32456 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GBP2P32456 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GBP2P32456 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GBP2P32456 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GBP2P32456 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GBP2P32456 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GBP2P32456 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GBP2P32456 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GBP2P32456 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GBP2P32456 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP2P32456 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP2P32456 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP2P32456 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP2P32456 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP2P32456 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP2P32456 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP2P32456 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP2P32456 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP2P32456 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP2P32456 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP2P32456 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GBP2P32456 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms