Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SsbP32067 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SsbP32067 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SsbP32067 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SsbP32067 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SsbP32067 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SsbP32067 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SsbP32067 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SsbP32067 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SsbP32067 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SsbP32067 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SsbP32067 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SsbP32067 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SsbP32067 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SsbP32067 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SsbP32067 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SsbP32067 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SsbP32067 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SsbP32067 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SsbP32067 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SsbP32067 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SsbP32067 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SsbP32067 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SsbP32067 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SsbP32067 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SsbP32067 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SsbP32067 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SsbP32067 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SsbP32067 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SsbP32067 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SsbP32067 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SsbP32067 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SsbP32067 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SsbP32067 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SsbP32067 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SsbP32067 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SsbP32067 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SsbP32067 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SsbP32067 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SsbP32067 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SsbP32067 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SsbP32067 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SsbP32067 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SsbP32067 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SsbP32067 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SsbP32067 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SsbP32067 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SsbP32067 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SsbP32067 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SsbP32067 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SsbP32067 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SsbP32067 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SsbP32067 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SsbP32067 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SsbP32067 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SsbP32067 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SsbP32067 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SsbP32067 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SsbP32067 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SsbP32067 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SsbP32067 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SsbP32067 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SsbP32067 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SsbP32067 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SsbP32067 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SsbP32067 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SsbP32067 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SsbP32067 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SsbP32067 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SsbP32067 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SsbP32067 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SsbP32067 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SsbP32067 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SsbP32067 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SsbP32067 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SsbP32067 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SsbP32067 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SsbP32067 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SsbP32067 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SsbP32067 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SsbP32067 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SsbP32067 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SsbP32067 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SsbP32067 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SsbP32067 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SsbP32067 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SsbP32067 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SsbP32067 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SsbP32067 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SsbP32067 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SsbP32067 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SsbP32067 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SsbP32067 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SsbP32067 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SsbP32067 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SsbP32067 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SsbP32067 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SsbP32067 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SsbP32067 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SsbP32067 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms