Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXA7P31268 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXA7P31268 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXA7P31268 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXA7P31268 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXA7P31268 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXA7P31268 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXA7P31268 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXA7P31268 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXA7P31268 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXA7P31268 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXA7P31268 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXA7P31268 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXA7P31268 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXA7P31268 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXA7P31268 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXA7P31268 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXA7P31268 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXA7P31268 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXA7P31268 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXA7P31268 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXA7P31268 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXA7P31268 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXA7P31268 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXA7P31268 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXA7P31268 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HOXA7P31268 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HOXA7P31268 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
HOXA7P31268 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HOXA7P31268 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HOXA7P31268 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXA7P31268 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXA7P31268 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXA7P31268 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXA7P31268 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXA7P31268 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXA7P31268 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXA7P31268 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXA7P31268 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXA7P31268 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXA7P31268 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HOXA7P31268 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HOXA7P31268 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HOXA7P31268 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HOXA7P31268 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
HOXA7P31268 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HOXA7P31268 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOXA7P31268 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOXA7P31268 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOXA7P31268 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOXA7P31268 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXA7P31268 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXA7P31268 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXA7P31268 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXA7P31268 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXA7P31268 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXA7P31268 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXA7P31268 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXA7P31268 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXA7P31268 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXA7P31268 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HOXA7P31268 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HOXA7P31268 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HOXA7P31268 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HOXA7P31268 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HOXA7P31268 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXA7P31268 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXA7P31268 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXA7P31268 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXA7P31268 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXA7P31268 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms