Protein–RNA interactions for Protein: P31040

SDHA, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAP31040 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAP31040 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAP31040 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAP31040 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAP31040 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAP31040 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAP31040 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAP31040 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHAP31040 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHAP31040 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAP31040 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAP31040 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAP31040 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAP31040 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAP31040 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAP31040 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHAP31040 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHAP31040 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHAP31040 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHAP31040 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHAP31040 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHAP31040 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHAP31040 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHAP31040 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHAP31040 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHAP31040 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHAP31040 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHAP31040 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAP31040 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAP31040 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAP31040 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAP31040 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHAP31040 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHAP31040 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHAP31040 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHAP31040 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SDHAP31040 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHAP31040 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHAP31040 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHAP31040 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHAP31040 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHAP31040 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHAP31040 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAP31040 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAP31040 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAP31040 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAP31040 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAP31040 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAP31040 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAP31040 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAP31040 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAP31040 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAP31040 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHAP31040 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHAP31040 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAP31040 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAP31040 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAP31040 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAP31040 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAP31040 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAP31040 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAP31040 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDHAP31040 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDHAP31040 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDHAP31040 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHAP31040 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHAP31040 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHAP31040 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAP31040 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAP31040 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAP31040 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAP31040 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAP31040 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAP31040 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAP31040 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAP31040 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAP31040 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAP31040 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAP31040 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAP31040 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAP31040 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAP31040 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAP31040 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAP31040 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAP31040 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHAP31040 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDHAP31040 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDHAP31040 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDHAP31040 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDHAP31040 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDHAP31040 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDHAP31040 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDHAP31040 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDHAP31040 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDHAP31040 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDHAP31040 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDHAP31040 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDHAP31040 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDHAP31040 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDHAP31040 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms