Protein–RNA interactions for Protein: P31025

LCN1, Lipocalin-1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P31025 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCN1P31025 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LCN1P31025 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCN1P31025 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCN1P31025 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LCN1P31025 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCN1P31025 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCN1P31025 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCN1P31025 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCN1P31025 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCN1P31025 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCN1P31025 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCN1P31025 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCN1P31025 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCN1P31025 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCN1P31025 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCN1P31025 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCN1P31025 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCN1P31025 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCN1P31025 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCN1P31025 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCN1P31025 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCN1P31025 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCN1P31025 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCN1P31025 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCN1P31025 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCN1P31025 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCN1P31025 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCN1P31025 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCN1P31025 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCN1P31025 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCN1P31025 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCN1P31025 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCN1P31025 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCN1P31025 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCN1P31025 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCN1P31025 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCN1P31025 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCN1P31025 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCN1P31025 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCN1P31025 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCN1P31025 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCN1P31025 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCN1P31025 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCN1P31025 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCN1P31025 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCN1P31025 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCN1P31025 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCN1P31025 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCN1P31025 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCN1P31025 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LCN1P31025 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LCN1P31025 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCN1P31025 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LCN1P31025 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LCN1P31025 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCN1P31025 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCN1P31025 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCN1P31025 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCN1P31025 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCN1P31025 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCN1P31025 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCN1P31025 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCN1P31025 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCN1P31025 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCN1P31025 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCN1P31025 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCN1P31025 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCN1P31025 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCN1P31025 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LCN1P31025 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCN1P31025 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCN1P31025 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCN1P31025 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCN1P31025 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCN1P31025 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCN1P31025 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCN1P31025 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCN1P31025 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCN1P31025 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCN1P31025 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCN1P31025 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCN1P31025 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCN1P31025 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCN1P31025 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCN1P31025 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCN1P31025 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCN1P31025 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCN1P31025 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCN1P31025 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCN1P31025 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCN1P31025 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCN1P31025 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCN1P31025 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LCN1P31025 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCN1P31025 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LCN1P31025 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCN1P31025 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCN1P31025 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCN1P31025 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms