Protein–RNA interactions for Protein: P30048

PRDX3, Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX3P30048 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDX3P30048 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDX3P30048 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDX3P30048 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDX3P30048 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDX3P30048 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDX3P30048 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDX3P30048 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDX3P30048 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDX3P30048 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDX3P30048 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDX3P30048 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDX3P30048 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDX3P30048 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDX3P30048 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDX3P30048 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRDX3P30048 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDX3P30048 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRDX3P30048 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDX3P30048 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDX3P30048 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDX3P30048 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDX3P30048 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDX3P30048 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDX3P30048 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDX3P30048 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDX3P30048 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDX3P30048 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDX3P30048 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDX3P30048 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDX3P30048 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDX3P30048 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDX3P30048 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDX3P30048 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDX3P30048 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDX3P30048 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDX3P30048 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDX3P30048 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDX3P30048 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms