Protein–RNA interactions for Protein: P30041

PRDX6, Peroxiredoxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX6P30041 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDX6P30041 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDX6P30041 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDX6P30041 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDX6P30041 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDX6P30041 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDX6P30041 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDX6P30041 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDX6P30041 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDX6P30041 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDX6P30041 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDX6P30041 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDX6P30041 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDX6P30041 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDX6P30041 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDX6P30041 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDX6P30041 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDX6P30041 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDX6P30041 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDX6P30041 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDX6P30041 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms