Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pabpc1P29341 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pabpc1P29341 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpc1P29341 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpc1P29341 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpc1P29341 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpc1P29341 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpc1P29341 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpc1P29341 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pabpc1P29341 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpc1P29341 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpc1P29341 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpc1P29341 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpc1P29341 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpc1P29341 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpc1P29341 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pabpc1P29341 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pabpc1P29341 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pabpc1P29341 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pabpc1P29341 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pabpc1P29341 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pabpc1P29341 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pabpc1P29341 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pabpc1P29341 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pabpc1P29341 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pabpc1P29341 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pabpc1P29341 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pabpc1P29341 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc1P29341 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pabpc1P29341 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pabpc1P29341 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pabpc1P29341 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pabpc1P29341 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms