Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kif5cP28738 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kif5cP28738 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kif5cP28738 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kif5cP28738 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kif5cP28738 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kif5cP28738 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kif5cP28738 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kif5cP28738 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kif5cP28738 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kif5cP28738 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kif5cP28738 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kif5cP28738 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kif5cP28738 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kif5cP28738 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kif5cP28738 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kif5cP28738 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kif5cP28738 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kif5cP28738 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kif5cP28738 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kif5cP28738 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kif5cP28738 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kif5cP28738 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kif5cP28738 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kif5cP28738 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kif5cP28738 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kif5cP28738 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kif5cP28738 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kif5cP28738 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kif5cP28738 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kif5cP28738 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kif5cP28738 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kif5cP28738 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kif5cP28738 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kif5cP28738 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kif5cP28738 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kif5cP28738 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kif5cP28738 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kif5cP28738 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kif5cP28738 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kif5cP28738 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kif5cP28738 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms