Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFS1P28331 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFS1P28331 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFS1P28331 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFS1P28331 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFS1P28331 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NDUFS1P28331 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFS1P28331 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFS1P28331 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFS1P28331 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFS1P28331 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFS1P28331 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NDUFS1P28331 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDUFS1P28331 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDUFS1P28331 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDUFS1P28331 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFS1P28331 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFS1P28331 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFS1P28331 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFS1P28331 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFS1P28331 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFS1P28331 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFS1P28331 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFS1P28331 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFS1P28331 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFS1P28331 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFS1P28331 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFS1P28331 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDUFS1P28331 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDUFS1P28331 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDUFS1P28331 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms