Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHATP28329 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHATP28329 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHATP28329 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHATP28329 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHATP28329 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHATP28329 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHATP28329 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHATP28329 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHATP28329 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHATP28329 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHATP28329 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHATP28329 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHATP28329 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHATP28329 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHATP28329 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHATP28329 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHATP28329 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHATP28329 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHATP28329 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHATP28329 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHATP28329 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHATP28329 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHATP28329 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHATP28329 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHATP28329 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHATP28329 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHATP28329 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHATP28329 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHATP28329 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHATP28329 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHATP28329 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHATP28329 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHATP28329 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHATP28329 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHATP28329 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHATP28329 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHATP28329 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHATP28329 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHATP28329 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHATP28329 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHATP28329 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHATP28329 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHATP28329 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHATP28329 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHATP28329 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHATP28329 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHATP28329 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHATP28329 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHATP28329 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHATP28329 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHATP28329 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHATP28329 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHATP28329 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHATP28329 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHATP28329 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHATP28329 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHATP28329 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHATP28329 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHATP28329 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHATP28329 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHATP28329 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHATP28329 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHATP28329 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHATP28329 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHATP28329 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHATP28329 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHATP28329 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHATP28329 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHATP28329 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHATP28329 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHATP28329 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHATP28329 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHATP28329 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHATP28329 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHATP28329 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHATP28329 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHATP28329 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHATP28329 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHATP28329 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHATP28329 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHATP28329 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHATP28329 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHATP28329 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHATP28329 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHATP28329 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHATP28329 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHATP28329 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHATP28329 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHATP28329 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHATP28329 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHATP28329 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHATP28329 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHATP28329 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHATP28329 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHATP28329 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHATP28329 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHATP28329 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHATP28329 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHATP28329 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms