Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa5P28312 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa5P28312 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa5P28312 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa5P28312 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa5P28312 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa5P28312 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa5P28312 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa5P28312 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Defa5P28312 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa5P28312 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa5P28312 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa5P28312 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms