Protein–RNA interactions for Protein: P28311

Defa4, Alpha-defensin 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa4P28311 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa4P28311 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa4P28311 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa4P28311 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa4P28311 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa4P28311 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa4P28311 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa4P28311 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa4P28311 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms