Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa2P28309 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa2P28309 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa2P28309 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa2P28309 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa2P28309 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa2P28309 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa2P28309 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa2P28309 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa2P28309 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa2P28309 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa2P28309 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa2P28309 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa2P28309 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa2P28309 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa2P28309 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa2P28309 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa2P28309 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa2P28309 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa2P28309 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa2P28309 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa2P28309 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa2P28309 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa2P28309 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa2P28309 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa2P28309 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa2P28309 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa2P28309 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa2P28309 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa2P28309 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa2P28309 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa2P28309 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa2P28309 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Defa2P28309 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa2P28309 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms