Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmb9P28076 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmb9P28076 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmb9P28076 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmb9P28076 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmb9P28076 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmb9P28076 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmb9P28076 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmb9P28076 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmb9P28076 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmb9P28076 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmb9P28076 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmb9P28076 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmb9P28076 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmb9P28076 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmb9P28076 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmb9P28076 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmb9P28076 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmb9P28076 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmb9P28076 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmb9P28076 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmb9P28076 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmb9P28076 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmb9P28076 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmb9P28076 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmb9P28076 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmb9P28076 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmb9P28076 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmb9P28076 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmb9P28076 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmb9P28076 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmb9P28076 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmb9P28076 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmb9P28076 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmb9P28076 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmb9P28076 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmb9P28076 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmb9P28076 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmb9P28076 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmb9P28076 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmb9P28076 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmb9P28076 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmb9P28076 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psmb9P28076 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psmb9P28076 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmb9P28076 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmb9P28076 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmb9P28076 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmb9P28076 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmb9P28076 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmb9P28076 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmb9P28076 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmb9P28076 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmb9P28076 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmb9P28076 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmb9P28076 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmb9P28076 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmb9P28076 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmb9P28076 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmb9P28076 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmb9P28076 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmb9P28076 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmb9P28076 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmb9P28076 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmb9P28076 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmb9P28076 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmb9P28076 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms