Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC38.37■■■■□ 3.73
DNMT1P26358 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
DNMT1P26358 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
DNMT1P26358 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
DNMT1P26358 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
DNMT1P26358 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
DNMT1P26358 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC38.35■■■■□ 3.73
DNMT1P26358 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
DNMT1P26358 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
DNMT1P26358 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
DNMT1P26358 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
DNMT1P26358 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
DNMT1P26358 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
DNMT1P26358 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
DNMT1P26358 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
DNMT1P26358 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
DNMT1P26358 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
DNMT1P26358 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
DNMT1P26358 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
DNMT1P26358 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
DNMT1P26358 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
DNMT1P26358 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
DNMT1P26358 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
DNMT1P26358 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
DNMT1P26358 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
DNMT1P26358 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
DNMT1P26358 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.71
DNMT1P26358 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
DNMT1P26358 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.25■■■■□ 3.71
DNMT1P26358 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
DNMT1P26358 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
DNMT1P26358 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
DNMT1P26358 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
DNMT1P26358 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC38.22■■■■□ 3.71
DNMT1P26358 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
DNMT1P26358 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
DNMT1P26358 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
DNMT1P26358 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
DNMT1P26358 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.21■■■■□ 3.71
DNMT1P26358 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
DNMT1P26358 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
DNMT1P26358 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
DNMT1P26358 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
DNMT1P26358 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.7
DNMT1P26358 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
DNMT1P26358 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
DNMT1P26358 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
DNMT1P26358 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
DNMT1P26358 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
DNMT1P26358 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
DNMT1P26358 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
DNMT1P26358 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
DNMT1P26358 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
DNMT1P26358 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
DNMT1P26358 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
DNMT1P26358 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
DNMT1P26358 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
DNMT1P26358 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
DNMT1P26358 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
DNMT1P26358 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
DNMT1P26358 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
DNMT1P26358 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
DNMT1P26358 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.7
DNMT1P26358 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
DNMT1P26358 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
DNMT1P26358 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
DNMT1P26358 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
DNMT1P26358 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
DNMT1P26358 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
DNMT1P26358 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
DNMT1P26358 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
DNMT1P26358 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
DNMT1P26358 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
DNMT1P26358 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
DNMT1P26358 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
DNMT1P26358 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
DNMT1P26358 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
DNMT1P26358 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC38.09■■■■□ 3.69
DNMT1P26358 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
DNMT1P26358 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
DNMT1P26358 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
DNMT1P26358 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
DNMT1P26358 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
DNMT1P26358 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
DNMT1P26358 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
DNMT1P26358 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
DNMT1P26358 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
DNMT1P26358 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
DNMT1P26358 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
DNMT1P26358 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
DNMT1P26358 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
DNMT1P26358 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
DNMT1P26358 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
DNMT1P26358 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
DNMT1P26358 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
DNMT1P26358 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
DNMT1P26358 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
DNMT1P26358 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
DNMT1P26358 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
DNMT1P26358 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC38■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms