Protein–RNA interactions for Protein: P26350

Ptma, Prothymosin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtmaP26350 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtmaP26350 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtmaP26350 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtmaP26350 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtmaP26350 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtmaP26350 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtmaP26350 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtmaP26350 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtmaP26350 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtmaP26350 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtmaP26350 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtmaP26350 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PtmaP26350 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PtmaP26350 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PtmaP26350 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PtmaP26350 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtmaP26350 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtmaP26350 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtmaP26350 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtmaP26350 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtmaP26350 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtmaP26350 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtmaP26350 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtmaP26350 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtmaP26350 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtmaP26350 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtmaP26350 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtmaP26350 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtmaP26350 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtmaP26350 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtmaP26350 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtmaP26350 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtmaP26350 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtmaP26350 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtmaP26350 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtmaP26350 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtmaP26350 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtmaP26350 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtmaP26350 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtmaP26350 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtmaP26350 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtmaP26350 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtmaP26350 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtmaP26350 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtmaP26350 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtmaP26350 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtmaP26350 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtmaP26350 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtmaP26350 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtmaP26350 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtmaP26350 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtmaP26350 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtmaP26350 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtmaP26350 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtmaP26350 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtmaP26350 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtmaP26350 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtmaP26350 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtmaP26350 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtmaP26350 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtmaP26350 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtmaP26350 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtmaP26350 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtmaP26350 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtmaP26350 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtmaP26350 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtmaP26350 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtmaP26350 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtmaP26350 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtmaP26350 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtmaP26350 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtmaP26350 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtmaP26350 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtmaP26350 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtmaP26350 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms