Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMA4P25789 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMA4P25789 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms