Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA1P25786 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA1P25786 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms