Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APCP25054 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APCP25054 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APCP25054 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APCP25054 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APCP25054 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APCP25054 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APCP25054 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APCP25054 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APCP25054 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APCP25054 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APCP25054 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APCP25054 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
APCP25054 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APCP25054 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APCP25054 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APCP25054 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APCP25054 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APCP25054 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APCP25054 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APCP25054 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APCP25054 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APCP25054 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APCP25054 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APCP25054 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APCP25054 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APCP25054 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APCP25054 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APCP25054 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
APCP25054 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APCP25054 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APCP25054 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APCP25054 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APCP25054 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APCP25054 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APCP25054 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APCP25054 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
APCP25054 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
APCP25054 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APCP25054 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APCP25054 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APCP25054 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
APCP25054 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APCP25054 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APCP25054 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APCP25054 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APCP25054 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APCP25054 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
APCP25054 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
APCP25054 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APCP25054 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
APCP25054 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APCP25054 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APCP25054 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APCP25054 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APCP25054 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APCP25054 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
APCP25054 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APCP25054 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APCP25054 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
APCP25054 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APCP25054 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APCP25054 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APCP25054 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APCP25054 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APCP25054 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APCP25054 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APCP25054 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APCP25054 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APCP25054 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APCP25054 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APCP25054 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APCP25054 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APCP25054 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APCP25054 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APCP25054 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
APCP25054 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APCP25054 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APCP25054 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APCP25054 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APCP25054 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APCP25054 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APCP25054 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APCP25054 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APCP25054 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APCP25054 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APCP25054 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APCP25054 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APCP25054 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APCP25054 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APCP25054 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APCP25054 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APCP25054 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APCP25054 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APCP25054 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APCP25054 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
APCP25054 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APCP25054 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APCP25054 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
APCP25054 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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