Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cdk11bP24788 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cdk11bP24788 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Cdk11bP24788 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cdk11bP24788 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cdk11bP24788 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cdk11bP24788 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cdk11bP24788 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Cdk11bP24788 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cdk11bP24788 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cdk11bP24788 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cdk11bP24788 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cdk11bP24788 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Cdk11bP24788 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cdk11bP24788 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cdk11bP24788 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cdk11bP24788 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cdk11bP24788 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Cdk11bP24788 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Cdk11bP24788 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Cdk11bP24788 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cdk11bP24788 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Cdk11bP24788 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Cdk11bP24788 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Cdk11bP24788 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Cdk11bP24788 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cdk11bP24788 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cdk11bP24788 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cdk11bP24788 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cdk11bP24788 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cdk11bP24788 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Cdk11bP24788 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
Cdk11bP24788 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Cdk11bP24788 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Cdk11bP24788 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Cdk11bP24788 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
Cdk11bP24788 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Cdk11bP24788 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Cdk11bP24788 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cdk11bP24788 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cdk11bP24788 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cdk11bP24788 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cdk11bP24788 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cdk11bP24788 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Cdk11bP24788 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cdk11bP24788 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cdk11bP24788 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Cdk11bP24788 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Cdk11bP24788 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Cdk11bP24788 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Cdk11bP24788 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cdk11bP24788 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cdk11bP24788 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cdk11bP24788 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cdk11bP24788 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cdk11bP24788 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Cdk11bP24788 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Cdk11bP24788 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cdk11bP24788 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cdk11bP24788 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cdk11bP24788 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cdk11bP24788 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cdk11bP24788 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cdk11bP24788 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cdk11bP24788 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cdk11bP24788 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cdk11bP24788 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cdk11bP24788 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Cdk11bP24788 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cdk11bP24788 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cdk11bP24788 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cdk11bP24788 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Cdk11bP24788 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cdk11bP24788 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cdk11bP24788 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cdk11bP24788 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cdk11bP24788 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cdk11bP24788 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cdk11bP24788 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cdk11bP24788 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Cdk11bP24788 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Cdk11bP24788 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cdk11bP24788 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cdk11bP24788 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cdk11bP24788 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cdk11bP24788 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cdk11bP24788 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cdk11bP24788 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cdk11bP24788 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cdk11bP24788 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Cdk11bP24788 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cdk11bP24788 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cdk11bP24788 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cdk11bP24788 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cdk11bP24788 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cdk11bP24788 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cdk11bP24788 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cdk11bP24788 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cdk11bP24788 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cdk11bP24788 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms