Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gria1P23818 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gria1P23818 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gria1P23818 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gria1P23818 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gria1P23818 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gria1P23818 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gria1P23818 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gria1P23818 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gria1P23818 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gria1P23818 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gria1P23818 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gria1P23818 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gria1P23818 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gria1P23818 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gria1P23818 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gria1P23818 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gria1P23818 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gria1P23818 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gria1P23818 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gria1P23818 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gria1P23818 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gria1P23818 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gria1P23818 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gria1P23818 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gria1P23818 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gria1P23818 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gria1P23818 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gria1P23818 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gria1P23818 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gria1P23818 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gria1P23818 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gria1P23818 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gria1P23818 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gria1P23818 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gria1P23818 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gria1P23818 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gria1P23818 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gria1P23818 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gria1P23818 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gria1P23818 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gria1P23818 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gria1P23818 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gria1P23818 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gria1P23818 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gria1P23818 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gria1P23818 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gria1P23818 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gria1P23818 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gria1P23818 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gria1P23818 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gria1P23818 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gria1P23818 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gria1P23818 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gria1P23818 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gria1P23818 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gria1P23818 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gria1P23818 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gria1P23818 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gria1P23818 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gria1P23818 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gria1P23818 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gria1P23818 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gria1P23818 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gria1P23818 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gria1P23818 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gria1P23818 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gria1P23818 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gria1P23818 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gria1P23818 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gria1P23818 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gria1P23818 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gria1P23818 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gria1P23818 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gria1P23818 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gria1P23818 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gria1P23818 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gria1P23818 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gria1P23818 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria1P23818 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gria1P23818 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gria1P23818 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.5 ms