Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Xrcc6P23475 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Xrcc6P23475 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Xrcc6P23475 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Xrcc6P23475 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Xrcc6P23475 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrcc6P23475 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrcc6P23475 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrcc6P23475 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrcc6P23475 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrcc6P23475 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrcc6P23475 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrcc6P23475 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrcc6P23475 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Xrcc6P23475 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Xrcc6P23475 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Xrcc6P23475 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Xrcc6P23475 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Xrcc6P23475 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrcc6P23475 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrcc6P23475 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrcc6P23475 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrcc6P23475 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrcc6P23475 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrcc6P23475 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Xrcc6P23475 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xrcc6P23475 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xrcc6P23475 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrcc6P23475 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrcc6P23475 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrcc6P23475 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrcc6P23475 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrcc6P23475 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrcc6P23475 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Xrcc6P23475 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Xrcc6P23475 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Xrcc6P23475 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Xrcc6P23475 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Xrcc6P23475 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Xrcc6P23475 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Xrcc6P23475 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Xrcc6P23475 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Xrcc6P23475 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Xrcc6P23475 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms