Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
XPAP23025 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
XPAP23025 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
XPAP23025 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XPAP23025 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
XPAP23025 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
XPAP23025 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPAP23025 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPAP23025 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPAP23025 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPAP23025 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPAP23025 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPAP23025 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPAP23025 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPAP23025 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
XPAP23025 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPAP23025 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPAP23025 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPAP23025 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPAP23025 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPAP23025 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPAP23025 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
XPAP23025 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPAP23025 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPAP23025 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPAP23025 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPAP23025 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPAP23025 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPAP23025 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPAP23025 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPAP23025 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPAP23025 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPAP23025 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPAP23025 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPAP23025 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
XPAP23025 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
XPAP23025 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPAP23025 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPAP23025 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPAP23025 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPAP23025 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPAP23025 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPAP23025 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPAP23025 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPAP23025 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPAP23025 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPAP23025 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPAP23025 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPAP23025 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPAP23025 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPAP23025 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPAP23025 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPAP23025 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
XPAP23025 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPAP23025 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPAP23025 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPAP23025 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPAP23025 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPAP23025 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPAP23025 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPAP23025 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPAP23025 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPAP23025 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPAP23025 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPAP23025 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPAP23025 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPAP23025 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPAP23025 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPAP23025 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
XPAP23025 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPAP23025 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPAP23025 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPAP23025 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
XPAP23025 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPAP23025 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPAP23025 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPAP23025 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPAP23025 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPAP23025 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPAP23025 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPAP23025 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPAP23025 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPAP23025 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPAP23025 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPAP23025 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
XPAP23025 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPAP23025 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPAP23025 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPAP23025 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPAP23025 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPAP23025 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPAP23025 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPAP23025 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPAP23025 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPAP23025 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPAP23025 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPAP23025 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPAP23025 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPAP23025 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPAP23025 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms