Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NR4A1P22736 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR4A1P22736 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms