Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CALB2P22676 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALB2P22676 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALB2P22676 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALB2P22676 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALB2P22676 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALB2P22676 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALB2P22676 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALB2P22676 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALB2P22676 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALB2P22676 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALB2P22676 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALB2P22676 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALB2P22676 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALB2P22676 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALB2P22676 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALB2P22676 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALB2P22676 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CALB2P22676 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALB2P22676 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALB2P22676 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALB2P22676 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALB2P22676 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALB2P22676 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALB2P22676 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALB2P22676 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALB2P22676 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALB2P22676 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALB2P22676 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALB2P22676 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALB2P22676 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALB2P22676 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALB2P22676 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALB2P22676 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALB2P22676 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALB2P22676 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALB2P22676 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALB2P22676 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CALB2P22676 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALB2P22676 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALB2P22676 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALB2P22676 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALB2P22676 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALB2P22676 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALB2P22676 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALB2P22676 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALB2P22676 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CALB2P22676 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALB2P22676 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CALB2P22676 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALB2P22676 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALB2P22676 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALB2P22676 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALB2P22676 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALB2P22676 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALB2P22676 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALB2P22676 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALB2P22676 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALB2P22676 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALB2P22676 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALB2P22676 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALB2P22676 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALB2P22676 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CALB2P22676 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALB2P22676 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALB2P22676 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALB2P22676 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALB2P22676 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALB2P22676 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALB2P22676 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALB2P22676 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALB2P22676 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALB2P22676 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALB2P22676 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALB2P22676 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALB2P22676 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALB2P22676 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALB2P22676 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALB2P22676 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALB2P22676 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALB2P22676 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALB2P22676 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALB2P22676 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALB2P22676 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALB2P22676 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALB2P22676 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALB2P22676 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALB2P22676 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALB2P22676 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALB2P22676 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALB2P22676 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALB2P22676 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALB2P22676 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALB2P22676 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALB2P22676 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALB2P22676 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALB2P22676 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALB2P22676 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALB2P22676 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALB2P22676 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1080.5 ms