Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TAF1P21675 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TAF1P21675 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TAF1P21675 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TAF1P21675 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TAF1P21675 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TAF1P21675 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TAF1P21675 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TAF1P21675 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TAF1P21675 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TAF1P21675 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TAF1P21675 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TAF1P21675 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TAF1P21675 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TAF1P21675 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TAF1P21675 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TAF1P21675 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TAF1P21675 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TAF1P21675 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TAF1P21675 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TAF1P21675 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TAF1P21675 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TAF1P21675 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TAF1P21675 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TAF1P21675 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TAF1P21675 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TAF1P21675 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TAF1P21675 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TAF1P21675 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TAF1P21675 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TAF1P21675 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TAF1P21675 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TAF1P21675 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TAF1P21675 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TAF1P21675 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TAF1P21675 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TAF1P21675 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TAF1P21675 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TAF1P21675 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
TAF1P21675 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TAF1P21675 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TAF1P21675 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TAF1P21675 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TAF1P21675 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TAF1P21675 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TAF1P21675 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TAF1P21675 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TAF1P21675 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TAF1P21675 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TAF1P21675 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TAF1P21675 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
TAF1P21675 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
TAF1P21675 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TAF1P21675 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TAF1P21675 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TAF1P21675 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TAF1P21675 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TAF1P21675 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TAF1P21675 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TAF1P21675 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TAF1P21675 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TAF1P21675 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TAF1P21675 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TAF1P21675 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TAF1P21675 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TAF1P21675 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TAF1P21675 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TAF1P21675 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
TAF1P21675 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TAF1P21675 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TAF1P21675 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TAF1P21675 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TAF1P21675 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TAF1P21675 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TAF1P21675 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TAF1P21675 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
TAF1P21675 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TAF1P21675 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
TAF1P21675 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TAF1P21675 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TAF1P21675 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TAF1P21675 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TAF1P21675 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TAF1P21675 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
TAF1P21675 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TAF1P21675 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TAF1P21675 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TAF1P21675 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
TAF1P21675 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TAF1P21675 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TAF1P21675 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
TAF1P21675 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TAF1P21675 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TAF1P21675 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TAF1P21675 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TAF1P21675 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
TAF1P21675 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
TAF1P21675 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TAF1P21675 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TAF1P21675 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms