Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmnb2P21619 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmnb2P21619 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmnb2P21619 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmnb2P21619 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmnb2P21619 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmnb2P21619 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmnb2P21619 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmnb2P21619 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmnb2P21619 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmnb2P21619 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmnb2P21619 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmnb2P21619 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmnb2P21619 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmnb2P21619 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmnb2P21619 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmnb2P21619 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmnb2P21619 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lmnb2P21619 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lmnb2P21619 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lmnb2P21619 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Lmnb2P21619 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmnb2P21619 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmnb2P21619 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmnb2P21619 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmnb2P21619 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmnb2P21619 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmnb2P21619 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmnb2P21619 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmnb2P21619 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmnb2P21619 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmnb2P21619 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmnb2P21619 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmnb2P21619 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmnb2P21619 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmnb2P21619 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmnb2P21619 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmnb2P21619 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmnb2P21619 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmnb2P21619 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmnb2P21619 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmnb2P21619 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmnb2P21619 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmnb2P21619 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmnb2P21619 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmnb2P21619 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmnb2P21619 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmnb2P21619 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmnb2P21619 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmnb2P21619 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmnb2P21619 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmnb2P21619 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmnb2P21619 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmnb2P21619 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmnb2P21619 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmnb2P21619 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmnb2P21619 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmnb2P21619 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmnb2P21619 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmnb2P21619 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmnb2P21619 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmnb2P21619 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmnb2P21619 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmnb2P21619 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmnb2P21619 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmnb2P21619 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmnb2P21619 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmnb2P21619 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmnb2P21619 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lmnb2P21619 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmnb2P21619 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmnb2P21619 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113 ms