Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCB4P21439 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCB4P21439 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCB4P21439 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCB4P21439 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCB4P21439 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCB4P21439 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCB4P21439 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCB4P21439 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCB4P21439 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCB4P21439 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCB4P21439 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCB4P21439 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCB4P21439 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCB4P21439 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCB4P21439 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCB4P21439 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCB4P21439 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCB4P21439 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCB4P21439 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCB4P21439 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCB4P21439 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCB4P21439 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCB4P21439 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCB4P21439 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB4P21439 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB4P21439 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB4P21439 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCB4P21439 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCB4P21439 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCB4P21439 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCB4P21439 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCB4P21439 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCB4P21439 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCB4P21439 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCB4P21439 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCB4P21439 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCB4P21439 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCB4P21439 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCB4P21439 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCB4P21439 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCB4P21439 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCB4P21439 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCB4P21439 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCB4P21439 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCB4P21439 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCB4P21439 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCB4P21439 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCB4P21439 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCB4P21439 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCB4P21439 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCB4P21439 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCB4P21439 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCB4P21439 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCB4P21439 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCB4P21439 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCB4P21439 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCB4P21439 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCB4P21439 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.5 ms