Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpm3P21107 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpm3P21107 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tpm3P21107 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tpm3P21107 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Tpm3P21107 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tpm3P21107 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpm3P21107 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpm3P21107 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpm3P21107 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpm3P21107 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpm3P21107 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpm3P21107 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpm3P21107 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpm3P21107 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpm3P21107 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tpm3P21107 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tpm3P21107 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpm3P21107 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpm3P21107 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpm3P21107 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpm3P21107 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpm3P21107 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpm3P21107 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpm3P21107 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpm3P21107 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpm3P21107 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpm3P21107 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpm3P21107 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpm3P21107 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpm3P21107 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpm3P21107 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpm3P21107 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpm3P21107 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpm3P21107 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpm3P21107 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpm3P21107 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpm3P21107 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms