Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDCP20941 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDCP20941 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDCP20941 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDCP20941 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDCP20941 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDCP20941 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDCP20941 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDCP20941 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDCP20941 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDCP20941 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDCP20941 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDCP20941 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDCP20941 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDCP20941 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PDCP20941 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDCP20941 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDCP20941 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDCP20941 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDCP20941 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PDCP20941 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PDCP20941 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDCP20941 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDCP20941 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDCP20941 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDCP20941 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDCP20941 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDCP20941 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDCP20941 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDCP20941 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDCP20941 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDCP20941 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDCP20941 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDCP20941 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDCP20941 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDCP20941 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDCP20941 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDCP20941 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PDCP20941 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDCP20941 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDCP20941 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDCP20941 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDCP20941 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDCP20941 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDCP20941 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDCP20941 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDCP20941 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDCP20941 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PDCP20941 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDCP20941 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDCP20941 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDCP20941 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDCP20941 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDCP20941 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDCP20941 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDCP20941 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDCP20941 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDCP20941 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDCP20941 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDCP20941 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDCP20941 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDCP20941 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDCP20941 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDCP20941 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDCP20941 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDCP20941 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDCP20941 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDCP20941 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDCP20941 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDCP20941 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDCP20941 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDCP20941 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDCP20941 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PDCP20941 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDCP20941 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDCP20941 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDCP20941 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDCP20941 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDCP20941 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDCP20941 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDCP20941 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDCP20941 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDCP20941 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDCP20941 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDCP20941 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDCP20941 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDCP20941 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDCP20941 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDCP20941 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDCP20941 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDCP20941 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDCP20941 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDCP20941 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDCP20941 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PDCP20941 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDCP20941 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PDCP20941 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PDCP20941 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDCP20941 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDCP20941 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms