Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL3P20749 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL3P20749 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BCL3P20749 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCL3P20749 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCL3P20749 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCL3P20749 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCL3P20749 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCL3P20749 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCL3P20749 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCL3P20749 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCL3P20749 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCL3P20749 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCL3P20749 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BCL3P20749 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BCL3P20749 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BCL3P20749 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCL3P20749 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCL3P20749 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCL3P20749 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCL3P20749 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCL3P20749 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BCL3P20749 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BCL3P20749 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BCL3P20749 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BCL3P20749 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BCL3P20749 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCL3P20749 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCL3P20749 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BCL3P20749 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCL3P20749 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCL3P20749 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCL3P20749 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BCL3P20749 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCL3P20749 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCL3P20749 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BCL3P20749 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCL3P20749 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BCL3P20749 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCL3P20749 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BCL3P20749 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCL3P20749 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BCL3P20749 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCL3P20749 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCL3P20749 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCL3P20749 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCL3P20749 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCL3P20749 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCL3P20749 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCL3P20749 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCL3P20749 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCL3P20749 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCL3P20749 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCL3P20749 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCL3P20749 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCL3P20749 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCL3P20749 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCL3P20749 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCL3P20749 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCL3P20749 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCL3P20749 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCL3P20749 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCL3P20749 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCL3P20749 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCL3P20749 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCL3P20749 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCL3P20749 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BCL3P20749 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BCL3P20749 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BCL3P20749 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BCL3P20749 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BCL3P20749 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BCL3P20749 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BCL3P20749 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BCL3P20749 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BCL3P20749 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BCL3P20749 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BCL3P20749 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BCL3P20749 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BCL3P20749 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BCL3P20749 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BCL3P20749 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BCL3P20749 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BCL3P20749 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BCL3P20749 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BCL3P20749 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BCL3P20749 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BCL3P20749 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BCL3P20749 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BCL3P20749 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BCL3P20749 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BCL3P20749 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BCL3P20749 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BCL3P20749 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BCL3P20749 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BCL3P20749 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BCL3P20749 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BCL3P20749 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BCL3P20749 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCL3P20749 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms