Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Prim1P20664 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Prim1P20664 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Prim1P20664 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Prim1P20664 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Prim1P20664 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Prim1P20664 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prim1P20664 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Prim1P20664 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prim1P20664 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prim1P20664 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prim1P20664 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Prim1P20664 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Prim1P20664 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prim1P20664 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Prim1P20664 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Prim1P20664 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Prim1P20664 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Prim1P20664 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Prim1P20664 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Prim1P20664 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prim1P20664 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prim1P20664 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prim1P20664 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Prim1P20664 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Prim1P20664 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Prim1P20664 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Prim1P20664 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Prim1P20664 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Prim1P20664 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Prim1P20664 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Prim1P20664 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Prim1P20664 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Prim1P20664 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Prim1P20664 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Prim1P20664 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Prim1P20664 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prim1P20664 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prim1P20664 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prim1P20664 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prim1P20664 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prim1P20664 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prim1P20664 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prim1P20664 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prim1P20664 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prim1P20664 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prim1P20664 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prim1P20664 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prim1P20664 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prim1P20664 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prim1P20664 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prim1P20664 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prim1P20664 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prim1P20664 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prim1P20664 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prim1P20664 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prim1P20664 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prim1P20664 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prim1P20664 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Prim1P20664 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Prim1P20664 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prim1P20664 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prim1P20664 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Prim1P20664 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prim1P20664 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prim1P20664 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prim1P20664 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Prim1P20664 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Prim1P20664 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prim1P20664 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prim1P20664 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Prim1P20664 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prim1P20664 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prim1P20664 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prim1P20664 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prim1P20664 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prim1P20664 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prim1P20664 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prim1P20664 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prim1P20664 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prim1P20664 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prim1P20664 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Prim1P20664 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prim1P20664 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prim1P20664 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Prim1P20664 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prim1P20664 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prim1P20664 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prim1P20664 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prim1P20664 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prim1P20664 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prim1P20664 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prim1P20664 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prim1P20664 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prim1P20664 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Prim1P20664 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prim1P20664 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prim1P20664 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prim1P20664 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prim1P20664 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms