Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pou5f1P20263 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pou5f1P20263 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pou5f1P20263 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pou5f1P20263 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pou5f1P20263 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pou5f1P20263 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pou5f1P20263 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pou5f1P20263 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pou5f1P20263 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pou5f1P20263 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pou5f1P20263 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pou5f1P20263 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pou5f1P20263 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pou5f1P20263 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pou5f1P20263 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pou5f1P20263 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pou5f1P20263 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pou5f1P20263 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pou5f1P20263 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pou5f1P20263 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pou5f1P20263 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pou5f1P20263 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms