Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ntf3P20181 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ntf3P20181 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ntf3P20181 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ntf3P20181 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ntf3P20181 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ntf3P20181 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ntf3P20181 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ntf3P20181 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ntf3P20181 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ntf3P20181 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ntf3P20181 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ntf3P20181 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ntf3P20181 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ntf3P20181 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ntf3P20181 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ntf3P20181 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ntf3P20181 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ntf3P20181 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ntf3P20181 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ntf3P20181 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ntf3P20181 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ntf3P20181 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ntf3P20181 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ntf3P20181 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ntf3P20181 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ntf3P20181 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1634.3 ms