Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERCC3P19447 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC3P19447 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC3P19447 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC3P19447 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC3P19447 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC3P19447 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC3P19447 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC3P19447 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC3P19447 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC3P19447 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC3P19447 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC3P19447 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC3P19447 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC3P19447 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC3P19447 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC3P19447 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC3P19447 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC3P19447 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC3P19447 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERCC3P19447 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ERCC3P19447 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERCC3P19447 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERCC3P19447 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERCC3P19447 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERCC3P19447 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERCC3P19447 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ERCC3P19447 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERCC3P19447 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERCC3P19447 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ERCC3P19447 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC3P19447 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC3P19447 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC3P19447 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC3P19447 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC3P19447 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC3P19447 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC3P19447 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC3P19447 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC3P19447 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC3P19447 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC3P19447 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC3P19447 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC3P19447 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC3P19447 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC3P19447 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC3P19447 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC3P19447 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC3P19447 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC3P19447 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC3P19447 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC3P19447 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC3P19447 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC3P19447 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERCC3P19447 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERCC3P19447 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERCC3P19447 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC3P19447 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC3P19447 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC3P19447 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC3P19447 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC3P19447 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC3P19447 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC3P19447 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC3P19447 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ERCC3P19447 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERCC3P19447 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERCC3P19447 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ERCC3P19447 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERCC3P19447 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERCC3P19447 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ERCC3P19447 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ERCC3P19447 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ERCC3P19447 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERCC3P19447 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC3P19447 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC3P19447 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC3P19447 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC3P19447 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC3P19447 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC3P19447 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC3P19447 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC3P19447 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC3P19447 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC3P19447 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC3P19447 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC3P19447 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC3P19447 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC3P19447 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC3P19447 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ERCC3P19447 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms