Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2CP19387 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2CP19387 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2CP19387 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2CP19387 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2CP19387 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2CP19387 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2CP19387 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2CP19387 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2CP19387 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2CP19387 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2CP19387 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2CP19387 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2CP19387 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2CP19387 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2CP19387 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2CP19387 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2CP19387 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2CP19387 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms