Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNI1P19237 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNI1P19237 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNI1P19237 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNI1P19237 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI1P19237 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI1P19237 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI1P19237 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI1P19237 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI1P19237 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNI1P19237 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNI1P19237 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNI1P19237 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNI1P19237 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNI1P19237 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNI1P19237 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNI1P19237 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNI1P19237 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNI1P19237 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNI1P19237 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNI1P19237 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNI1P19237 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNI1P19237 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNI1P19237 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNI1P19237 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNI1P19237 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNI1P19237 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNI1P19237 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNI1P19237 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNI1P19237 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNI1P19237 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNI1P19237 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNI1P19237 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNI1P19237 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNI1P19237 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNI1P19237 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNI1P19237 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNI1P19237 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNI1P19237 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNI1P19237 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNI1P19237 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNNI1P19237 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNI1P19237 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNI1P19237 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNI1P19237 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNI1P19237 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNI1P19237 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNI1P19237 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNI1P19237 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNI1P19237 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNI1P19237 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNI1P19237 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNI1P19237 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNI1P19237 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNI1P19237 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNI1P19237 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNI1P19237 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNI1P19237 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNI1P19237 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNI1P19237 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNI1P19237 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNI1P19237 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNI1P19237 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNI1P19237 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNNI1P19237 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNNI1P19237 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNNI1P19237 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI1P19237 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI1P19237 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI1P19237 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI1P19237 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI1P19237 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNI1P19237 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNI1P19237 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms