Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH2P19022 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH2P19022 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH2P19022 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH2P19022 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH2P19022 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH2P19022 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH2P19022 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH2P19022 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH2P19022 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH2P19022 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH2P19022 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH2P19022 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH2P19022 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH2P19022 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH2P19022 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH2P19022 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH2P19022 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH2P19022 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH2P19022 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH2P19022 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH2P19022 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH2P19022 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH2P19022 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH2P19022 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH2P19022 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH2P19022 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH2P19022 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH2P19022 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH2P19022 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH2P19022 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH2P19022 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH2P19022 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH2P19022 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH2P19022 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH2P19022 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH2P19022 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH2P19022 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH2P19022 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH2P19022 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH2P19022 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH2P19022 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH2P19022 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH2P19022 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH2P19022 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH2P19022 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH2P19022 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH2P19022 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH2P19022 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH2P19022 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH2P19022 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH2P19022 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH2P19022 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH2P19022 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH2P19022 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH2P19022 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH2P19022 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH2P19022 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH2P19022 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH2P19022 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH2P19022 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH2P19022 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH2P19022 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH2P19022 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH2P19022 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH2P19022 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH2P19022 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH2P19022 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH2P19022 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH2P19022 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH2P19022 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH2P19022 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH2P19022 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH2P19022 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH2P19022 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH2P19022 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH2P19022 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH2P19022 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH2P19022 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDH2P19022 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH2P19022 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH2P19022 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH2P19022 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH2P19022 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH2P19022 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH2P19022 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH2P19022 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH2P19022 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH2P19022 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH2P19022 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH2P19022 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH2P19022 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH2P19022 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH2P19022 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH2P19022 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH2P19022 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH2P19022 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH2P19022 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH2P19022 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH2P19022 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms