Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RargP18911 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RargP18911 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RargP18911 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RargP18911 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RargP18911 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RargP18911 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RargP18911 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RargP18911 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RargP18911 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RargP18911 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RargP18911 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RargP18911 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RargP18911 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RargP18911 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RargP18911 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RargP18911 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RargP18911 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RargP18911 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RargP18911 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RargP18911 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RargP18911 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RargP18911 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RargP18911 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RargP18911 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RargP18911 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RargP18911 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RargP18911 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RargP18911 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RargP18911 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RargP18911 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RargP18911 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RargP18911 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RargP18911 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RargP18911 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RargP18911 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RargP18911 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RargP18911 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RargP18911 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RargP18911 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RargP18911 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RargP18911 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RargP18911 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RargP18911 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RargP18911 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RargP18911 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RargP18911 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RargP18911 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RargP18911 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RargP18911 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RargP18911 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RargP18911 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RargP18911 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RargP18911 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RargP18911 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RargP18911 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RargP18911 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RargP18911 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RargP18911 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RargP18911 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RargP18911 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RargP18911 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RargP18911 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RargP18911 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RargP18911 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RargP18911 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
RargP18911 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RargP18911 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RargP18911 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RargP18911 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RargP18911 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RargP18911 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RargP18911 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RargP18911 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RargP18911 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RargP18911 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RargP18911 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RargP18911 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RargP18911 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RargP18911 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RargP18911 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RargP18911 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RargP18911 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RargP18911 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RargP18911 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RargP18911 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RargP18911 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RargP18911 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RargP18911 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RargP18911 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RargP18911 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RargP18911 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RargP18911 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RargP18911 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RargP18911 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RargP18911 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RargP18911 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RargP18911 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RargP18911 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RargP18911 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms