Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFEP18615 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFEP18615 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFEP18615 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFEP18615 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFEP18615 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFEP18615 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFEP18615 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFEP18615 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFEP18615 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFEP18615 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFEP18615 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFEP18615 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFEP18615 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NELFEP18615 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NELFEP18615 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NELFEP18615 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NELFEP18615 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NELFEP18615 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NELFEP18615 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NELFEP18615 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NELFEP18615 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NELFEP18615 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NELFEP18615 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NELFEP18615 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NELFEP18615 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NELFEP18615 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NELFEP18615 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NELFEP18615 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELFEP18615 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELFEP18615 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELFEP18615 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELFEP18615 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELFEP18615 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELFEP18615 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELFEP18615 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELFEP18615 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELFEP18615 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELFEP18615 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELFEP18615 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NELFEP18615 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NELFEP18615 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NELFEP18615 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NELFEP18615 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NELFEP18615 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NELFEP18615 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NELFEP18615 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NELFEP18615 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NELFEP18615 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NELFEP18615 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NELFEP18615 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NELFEP18615 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NELFEP18615 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NELFEP18615 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NELFEP18615 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NELFEP18615 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELFEP18615 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELFEP18615 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELFEP18615 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELFEP18615 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFEP18615 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFEP18615 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFEP18615 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFEP18615 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFEP18615 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFEP18615 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFEP18615 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFEP18615 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFEP18615 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFEP18615 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFEP18615 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFEP18615 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFEP18615 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFEP18615 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFEP18615 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELFEP18615 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFEP18615 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFEP18615 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFEP18615 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFEP18615 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFEP18615 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFEP18615 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFEP18615 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFEP18615 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFEP18615 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFEP18615 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFEP18615 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFEP18615 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFEP18615 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFEP18615 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFEP18615 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFEP18615 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
NELFEP18615 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFEP18615 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFEP18615 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFEP18615 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NELFEP18615 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NELFEP18615 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NELFEP18615 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NELFEP18615 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms