Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDE6GP18545 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6GP18545 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms